Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ttc21bQ0HA38 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms