Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Zfp207-208ENSMUST00000188489 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm44641-201ENSMUST00000152342 323 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp9xP70398 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms