Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms