Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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