Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm5538W4VSP6 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm5538W4VSP6 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm5538W4VSP6 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm5538W4VSP6 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms