Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ercc8Q8CFD5 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms