Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s74-201ENSMUST00000082654 116 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm14762-202ENSMUST00000122953 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm23403-201ENSMUST00000179169 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.8 ms