Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Zfp946-202ENSMUST00000120222 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Lingo2-204ENSMUST00000108124 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Npy2r-204ENSMUST00000182831 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Flrt3-201ENSMUST00000056760 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sptan1P16546 Arhgef3-201ENSMUST00000049206 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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