Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm43219-201ENSMUST00000197972 1937 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Serpina3f-201ENSMUST00000101080 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Elp3-203ENSMUST00000225355 2771 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Lin7a-202ENSMUST00000105280 1634 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms