Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Cacnb2-214ENSMUST00000193800 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm45705-201ENSMUST00000211831 2134 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Msh4-205ENSMUST00000190449 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gpatch2-208ENSMUST00000160570 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Rtkn2-202ENSMUST00000105437 3932 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Rfpl4-201ENSMUST00000045215 1598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm10556-201ENSMUST00000180904 3906 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Arfgef2-201ENSMUST00000099078 8770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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