Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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