Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Scml4-202ENSMUST00000105494 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 5730455P16Rik-201ENSMUST00000103225 4554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Chd1P40201 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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