Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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