Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
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Ccdc18Q640L5 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ccdc18Q640L5 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ccdc18Q640L5 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ccdc18Q640L5 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ccdc18Q640L5 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ccdc18Q640L5 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ccdc18Q640L5 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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