Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Q3U6N9 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Q3U6N9 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Q3U6N9 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms