Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.8 ms