Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm37673-201ENSMUST00000194880 2451 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC160118.1-201ENSMUST00000214497 2457 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 4930543N07Rik-201ENSMUST00000209357 1364 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC154634.1-201ENSMUST00000225225 2394 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Slc25a35-201ENSMUST00000018884 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Trpd52l3-201ENSMUST00000025727 2231 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm26792-201ENSMUST00000180538 2799 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 4833417C18Rik-201ENSMUST00000146868 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Fgfbp1-201ENSMUST00000061299 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Champ1-202ENSMUST00000128557 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm37314-201ENSMUST00000193545 2685 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Zfp180-202ENSMUST00000203854 3845 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gpkow-201ENSMUST00000049896 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Snhg7os-202ENSMUST00000131841 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Tmem69-202ENSMUST00000106478 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm45280-201ENSMUST00000210484 2552 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Zscan26-202ENSMUST00000110485 4366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Frk-201ENSMUST00000019913 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Tbc1d24-208ENSMUST00000201089 4081 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Stmn1-202ENSMUST00000105867 802 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms