Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P18530 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P18530 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms