Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Ttc21a-201ENSMUST00000035100 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp185-203ENSMUST00000164800 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Zmynd8-201ENSMUST00000018050 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Fam228a-204ENSMUST00000222363 2284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Ak7-201ENSMUST00000040876 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 CT009536.1-201ENSMUST00000223774 2151 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm38130-201ENSMUST00000194311 1761 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gria2-202ENSMUST00000107745 4026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Dhcr7-207ENSMUST00000141916 2752 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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