Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm14762-202ENSMUST00000122953 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rnf4Q9QZS2 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rnf4Q9QZS2 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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