Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Col5a3Q9JLI2 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Col5a3Q9JLI2 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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