Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Mir185-201ENSMUST00000083530 65 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Ece2-208ENSMUST00000120394 3432 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Osbpl1a-202ENSMUST00000117361 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Bdnf-206ENSMUST00000111046 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm14648-201ENSMUST00000119328 483 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Rpl21-ps15-201ENSMUST00000121545 483 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm34304-201ENSMUST00000218927 1139 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Rpl21-ps7-201ENSMUST00000077420 483 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm10472-201ENSMUST00000193014 2102 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Tfcp2l1-201ENSMUST00000027629 9269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Clasp1-221ENSMUST00000191823 3916 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms