Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ccdc18Q640L5 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ccdc18Q640L5 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ccdc18Q640L5 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc18Q640L5 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms