Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4930473H19Rik-202ENSMUST00000222124 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC125223.1-201ENSMUST00000224004 749 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm28244-201ENSMUST00000189342 356 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC132863.1-201ENSMUST00000228413 751 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm23037-201ENSMUST00000083874 324 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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