Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms