Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H3f3aP84244 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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