Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Adgrf4-203ENSMUST00000167993 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC093043.2-201ENSMUST00000228616 2017 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC162934.2-201ENSMUST00000221451 249 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms