Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms