Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20830J3KML6 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms