Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 4930524O08Rik-202ENSMUST00000184444 2719 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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