Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CltcQ68FD5 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms