Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Puf60Q3UEB3 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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