Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms