Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9xP70398 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm12970-201ENSMUST00000134911 581 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm20745-201ENSMUST00000216827 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms