Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P18530 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18530 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18530 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms