Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cab39lQ9DB16 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms