Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Usp54Q8BL06 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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