Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ttc29Q80VM3 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms