Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
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Usp19Q3UJD6 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Usp19Q3UJD6 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Usp19Q3UJD6 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Usp19Q3UJD6 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Usp19Q3UJD6 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Usp19Q3UJD6 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Usp19Q3UJD6 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Usp19Q3UJD6 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp19Q3UJD6 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
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