Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms