Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd3Q9Z2D8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms