Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd4Q9Z2D7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms