Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1Q9Z179 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms