Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpne6Q9Z140 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms