Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xpr1Q9Z0U0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms