Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn3Q9WUK7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms