Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms