Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptpn4Q9WU22 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms