Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax2Q9WTP9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vax2Q9WTP9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms