Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PplQ9R269 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PplQ9R269 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PplQ9R269 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PplQ9R269 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PplQ9R269 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PplQ9R269 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PplQ9R269 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PplQ9R269 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PplQ9R269 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PplQ9R269 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PplQ9R269 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PplQ9R269 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PplQ9R269 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PplQ9R269 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PplQ9R269 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms